Os cuento el orden que sigo para sincronizar el audio (truco incluido):
1 - Extraigo el audio del fichero AVI (peli original).
2 - El audio desincronizado lo convierto a WAV (normalmente es MP3).
3 - Extraigo el vídeo del fichero AVI (sólo vídeo).
4 - TRUCO: si el vídeo es XVID, creo una copia de seguridad y con el fourcc.exe le cambio el description y el used codec a "DIVX".
5 - Desde el Sound Forge abro el audio desincronizado y el vídeo con el codec cambiado a DIVX. Si intento abrir un XVID no lo reconoce, aunque tenga instalados los codecs.
6 - Lo más chungo, sincronizar el audio

7 - Una vez listo el tema, convierto ambos audios a MP3 o a OGG (según lo que vaya a hacer) y los multiplexo con el fichero de vídeo original (el que no tenía cambiado los codec).
8 - A compartir
Espero haber sido de utilidad